Lokasi yang dipilih untuk kegiatan SMART-Fish Indonesia ini adalah di Propinsi Jambi, Jawa Timur, Sulawesi Selatan dan Nusa Tenggara Timur. Pemilihan tiga rantai nilai (value chains) unggulan yaitu pole & line tuna, patin dan rumput laut secara umum berdasarkan pertimbangan berikut :

Keanekaragaman rantai nilai yang meliputi penangkapan dan budidaya termasuk rumput laut;
Dampak positif yang besar terhadap kehidupan sosial dan ekonomi masyarakat yang terlibat baik di tingkat lokal, regional maupun nasional melalui penerapan praktek-praktek yang berkelanjutan, khususnya pada kelompok berpenghasilan rendah dan wanita;
Potensi yang besar untuk dikembangkan secara luas melibatkan komunitas yang lebih besar di tempat-tempat lainnya di Indonesia;
Adanya efisiensi sumber daya dan potensi pengurangan limbah sepanjang rantai nilai.